肿瘤突变负荷相关免疫基因预测胃癌预后模型的构建与验证开题报告

 2023-09-08 09:14:01

1. 研究目的与意义

胃癌是全球范围内第五大常见恶性肿瘤,也是癌症相关死亡的第三大原因。据估计,2018年新增胃癌患者超过100万,记录在册的胃癌死亡病例约783000例。尽管在预防和治疗措施方面取得了进展,但不幸的是,胃癌患者的总生存率仍然很低。胃癌的不良预后主要是由于病情发现较晚以及缺乏用于早期发现的有效诊断标志物。即使采用综合疗法,晚期胃癌患者的预后也只是略有改善。因此,探索新的分子诊断标志物对胃癌的有效治疗至关重要。

免疫治疗已然成为一种重要而有前途的癌症治疗方法,对不同类型的癌症(如胃癌)均有疗效。然而,许多新的免疫疗法仍处于早期研究阶段,免疫检查点阻断(ICB)反应的潜在机制复杂。幸运的是,肿瘤突变负荷 (TMB) 是一种评估癌细胞携带的突变的方法,已成为跨各种癌症类型评估 ICB 效果的有用分子生物标志物。更高的TMB可能导致形成更多的新抗原,这可能使肿瘤更具有免疫原性。有报道称TMB能影响免疫细胞浸润和炎症反应,并能改变各种类型的癌症的免疫治疗效果和预后。此外,免疫相关基因可能在包括胃癌在内的多种恶性肿瘤的免疫治疗中发挥重要作用。

迄今为止,许多研究探讨了TMB对癌症预后的影响。许多研究人员已经针对不同类型的癌症(包括胃癌)构建了免疫相关基因的预后模型。然而,关于TMB相关免疫基因与胃癌预后相关模型的研究仍然有限。因此,本研究旨在探索TMB的预后价值,并识别和确认一种基于TMB相关免疫基因的新型胃癌预后模型。本研究中识别的免疫基因可能作为胃癌治疗潜在的分子生物标志物。

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2. 研究内容和问题

迄今为止,许多研究探讨了TMB对癌症预后的影响。

许多研究人员已经针对不同类型的癌症(包括胃癌)构建了免疫相关基因的预后模型。

然而,关于TMB相关免疫基因与胃癌预后相关模型的研究仍然有限。

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3. 设计方案和技术路线

1. 数据来源:从the Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库下载数据,对TMB进行相关分析。共从ImmPort网站 (https://www.immport.org/) 下载了1395个免疫基因。并在GEO数据集(GSE84437)中验证其预后功能。

2. 研究方法:

(1)个体TMB值计算:TMB值 = 每个样本的突变总数/外显子长度。

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4. 研究的条件和基础

(1)课题由经验丰富,严谨负责的老师负责指导;

(2)可在学校图书馆查阅相关的图书、报刊、杂志等;

(3)登陆校互联网可搜索相关的文献资料;

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