利用CRISR-Cas9基因编辑技术建立抗病毒蛋白PKR基因敲除细胞系开题报告

 2024-06-10 19:17:14

1. 本选题研究的目的及意义

近年来,新发病毒性传染病频繁爆发,对人类健康和社会稳定构成严重威胁。

其中,很多病毒感染难以预防和治疗,因此,深入研究病毒与宿主相互作用机制、开发新的抗病毒药物和治疗策略具有重要意义。

双链RNA依赖性蛋白激酶(double-strandedRNA-dependentproteinkinase,PKR)是宿主细胞中一种重要的抗病毒蛋白,能够被病毒RNA激活并磷酸化真核起始因子2α(eIF2α),从而抑制病毒蛋白合成,发挥广谱抗病毒作用。

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2. 本选题国内外研究状况综述

#PKR与病毒感染PKR作为一种重要的抗病毒蛋白,其功能和作用机制一直是国内外研究的热点。

##国内研究现状国内学者在PKR抗病毒机制研究方面取得了一系列进展。

例如,李刚等[1]研究发现,PKR能够抑制寨卡病毒复制,并揭示了其潜在的分子机制。

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3. 本选题研究的主要内容及写作提纲

#主要内容本研究将利用CRISPR-Cas9基因编辑技术对细胞系进行基因编辑,敲除PKR基因,并对敲除后的细胞系进行鉴定。

1.设计并构建针对PKR基因的CRISPR-Cas9载体;2.将CRISPR-Cas9载体转染至目标细胞系;3.对转染后的细胞进行筛选,获得PKR基因敲除的细胞克隆;4.利用PCR、测序等技术对PKR基因敲除细胞系进行鉴定;5.利用WesternBlot等技术检测PKR蛋白表达水平,进一步验证基因敲除效果;6.对PKR基因敲除细胞系的生物学特性进行初步研究,例如细胞生长曲线、病毒复制能力等。

#写作提纲
第1章绪论
1.1CRISPR-Cas9技术概述
1.2抗病毒蛋白PKR的功能与机制
1.3PKR基因敲除细胞系的研究意义
1.4本研究的目的和意义
第2章材料与方法
2.1实验材料
2.2CRISPR-Cas9载体构建
2.3细胞转染与筛选
2.4PKR基因敲除细胞系的鉴定
2.5脱靶效应分析
第3章结果
3.1CRISPR-Cas9载体构建及鉴定
3.2PKR基因敲除细胞系的筛选
3.3PKR基因敲除效率的测定
3.4脱靶效应分析结果
第4章讨论
4.1CRISPR-Cas9技术构建PKR基因敲除细胞系的效率
4.2PKR基因敲除对细胞表型的影响
4.3PKR基因敲除细胞系的应用前景
4.4本研究的不足与展望
第5章结论
5.1成功构建了PKR基因敲除细胞系
5.2PKR基因敲除效率达到预期
5.3本研究为相关病毒研究提供了新的细胞模型
第6章展望
6.1利用该细胞系进行病毒复制机制研究
6.2筛选新的抗病毒药物靶点
6.3探索PKR基因与其他基因的相互作用

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4. 研究的方法与步骤

本研究将采用以下方法与步骤:
1.细胞培养:选择合适的细胞系进行培养,例如HEK293T细胞、HeLa细胞等。

2.sgRNA设计与合成:根据PKR基因序列设计并合成针对PKR基因的特异性sgRNA,并克隆至CRISPR-Cas9表达载体。

3.细胞转染:将构建好的CRISPR-Cas9表达载体转染至目标细胞系,利用抗生素筛选获得稳定表达Cas9蛋白和sgRNA的细胞系。

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5. 研究的创新点

本研究拟利用CRISPR-Cas9技术构建PKR基因敲除细胞系,与传统RNAi技术相比,CRISPR-Cas9技术具有更高的基因敲除效率和更低的脱靶效应,能够更精准地研究PKR基因的功能。


此外,本研究还将对PKR基因敲除细胞系进行病毒感染实验,探究PKR基因敲除对病毒复制的影响,为深入研究PKR抗病毒机制提供新的思路。

6. 计划与进度安排

第一阶段 (2024.12~2024.1)确认选题,了解毕业论文的相关步骤。

第二阶段(2024.1~2024.2)查询阅读相关文献,列出提纲

第三阶段(2024.2~2024.3)查询资料,学习相关论文

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7. 参考文献(20个中文5个英文)

1. 刘晓敏, 张晓燕, 张永亮, 等. CRISPR/Cas9技术构建基因敲除细胞系的应用研究进展[J]. 中国细胞生物学学报, 2020, 42(07): 1357-1366.

2. 李婷, 黄波. 基于CRISPR/Cas9技术的基因敲除细胞系建立[J]. 中华检验医学杂志, 2018, 41(02): 146-150.

3. 陈丽梅, 杨芳, 邓华瑜, 等. CRISPR/Cas9技术构建稳定基因敲除细胞株的研究进展[J]. 生物技术通报, 2017, 33(04): 6-12.

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