1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)
文 献 综 述摘要:萝卜作为一种我国普遍种植的农作物,具有十分重要的生产意义和商品价值。
但是由于生长贮存过程中,水分温度等环境因素的影响,产品往往会出现糠心的病变,肉质根重量减轻,营养成分含量减少,大大损害其经济效益。
本课题以此为出发点,利用转录组测序技术建立耐糠与易糠萝卜不同组织的基因组文库,进行差异转录组分析,比较不同组织中基因上调和下调的表达模式,对相关影响其肉质根发育的基因进行挖掘,再利用实时荧光定量PCR技术进行基因的表达验证,最后利用基因工程的手段改良作物,从而培育出耐糠的新品种,提升其商品经济效益。
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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案
一、要研究的问题1、验证转录组数据的可信度;2、探究萝卜品种呈现耐糠和易糠的关键差异基因;3、从转录组数据中挖掘肉质根发育相关基因。
二 二、研究手段1、随机挑选5-8个基因,通过实时荧光定量PCR技术验证转录组数据可信度;2、利用RNA-seq测序技术进行分析,对萝卜的不同组织(髓部和叶子)进行差异基因分析;3、将筛选到的差异基因进行GO、KEGG富集分析;4、通过查阅文献,挖掘肉质根发育相关基因,包括细胞壁代谢相关、木质素相关、植物激素相关,对上述基因通过PlantPAN3.0进行转录因子预测
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