NLR1-V互作基因PAL的筛选和基于VIGS技术的初步功能验证开题报告

 2023-02-18 22:16:06

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

课题意义:

小麦是世界上重要的粮食作物之一,其富含淀粉、蛋白质等营养物质,可用来生产面包、馒头等主食,具备重要的营养价值。我国是世界上小麦生产、消费大国,主产区有黄淮冬麦区、西北春麦区以及新疆西藏冬春兼种麦区等十大麦区。

小麦白粉病是由白粉病菌(Blumeria graminis f. sp. tritici)引起的一种世界性真菌病害。小麦产生白粉病后,光合作用减少,呼吸和蒸腾作用加剧,养分大量流失,导致严重减产。近年来,世界主要麦区白粉病的危害日趋严重,由次要病害上升为主要病害[1]

剩余内容已隐藏,您需要先支付后才能查看该篇文章全部内容!

2. 研究的基本内容和问题

研究的目标、内容和拟解决的关键问题:

研究目标:

1.对Pm21在小麦抗病通路中与哪些蛋白有互作进行初步筛选,获得候选基因。

剩余内容已隐藏,您需要先支付后才能查看该篇文章全部内容!

3. 研究的方法与方案

研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析

研究方法:

1.克隆候选基因

根据目的基因序列,设计引物,通过进行PCR、胶回收、连接拓扑载体、大肠杆菌连接转化、挑取单克隆做菌液pcr一系列步骤,送去公司测序比对,验证测序成功即成功克隆目的基因。

2.构建候选基因VIGS载体

根据候选基因的序列设计引物,进行PCR扩增、胶回收DNA产物。

利用Nhe 1 酶切γ-PDS载体,获得γ-片段

克隆候选基因的VIGS片段和NheI酶切后的γ-片段进行体外同源重组,连接构建目的基因的BSMV重组载体

将连接后的产物进行转化培养,挑取单克隆做菌液pcr,送公司测序验证载体是否构建成功。

3.病毒载体线性化

将BSMV病毒载体α、β、γ-空、γ-PDS以及成功连接有目标基因片段的重组载体进行高纯度质粒提取,应用于载体的线性化。

其中α、γ载体用MluI,β用SpeI分别进行线性化酶切。

取1μL上述线性化产物稀释10倍,分别用1.0%琼脂糖凝胶电泳检测,确保酶切各质粒模板已完全线性化。

纯化酶切完全后的线性化产物。

4.体外转录

将经过线性化纯化的质粒作为模板,进行体外转录。

将体外转录产物稀释10倍,分别用1.0%琼脂糖凝胶电泳检测,并测定浓度。

转录产物置于-80℃保存备用,用于接种实验。

5.病毒接种

将包含与Pm21互作基因目标片段的利用大麦花叶病毒诱导基因沉默(BSWV-VIGS)技术,表达载体涂抹至二叶期小麦叶片上以沉默筛选出有功能的互作基因。

培养一批繁菌苗,适时完成对沉默植株进行的白粉病菌接种。

6.剪下具有病毒表型的叶片,脱色后用考马斯亮蓝染色,观察离体鉴定叶片,并在显微镜下微观观察菌丝发育情况,统计菌丝数量。

技术路线:

筛选Pm21互作基因

有功能的互作基因 → 回补验证

构建病毒载体

繁菌苗 → 接种苗

功能解析

实验方案:

1.材料种植

2018年10月,种植92R137材料于宜兴,10月20日播种。常规田间管理。

获得酵母AH109菌株(Trp,Leu,His,Ade表达缺陷菌株)

2.候选基因和VIGS载体片段扩增pcr体系:2xPhanta Mix

Mix

5.0μL

ddH2O

3.2μL

F/R

0.4/0.4μg

模板up to

10μL

PCR程序为:94℃预变性3min,95℃高温变性15s,57℃退火15s,72℃延伸2.5min,共35个循环,72℃延伸5min,10℃保存。

3.候选基因和VISG载体菌液pcr体系,2xTaq体系

Mix

3.6μL

ddH2O

5.0μL

F/R

0.2/0.2μg

模板up to

10μL

PCR程序为:94℃预变性3min,93℃高温变性30s,52℃退火45s,72℃延伸2min,共32个循环。72℃延伸10min,10℃保存。

4.拓扑载体连接体系:

PCR产物

0.5-8μL

拓扑载体

1.0μL

10xEnhancer

1.0μL

ddH2O up to

10μL

5.体外同源重组体系

5xCE Buffer

2.0μL

目的基因

20-200ng

γ载体

50-200ng

ExnaseII

1.0μL

ddH2O up to

10μL

6.大肠杆菌连接转化步骤

(1)将感受态在冰上放置1min溶解,轻弹混匀

(2)将10μLDNA产物加入感受态中,冰置25min

(3)42℃热激90s

(4)冰置2min,加800μLLBO摇45min-1h

(5)离心5000x3min,准备涂布材料

(6)倒掉上清液,余100μL左右,吸至平板上,涂布过夜培养

7.重组载体酶切体系

(1)重组病毒载体、α、γ、γ-空及γ-PDS病毒载体质粒线性化体系如下。37℃孵育6h。

10×H Buffer

5.0μL

Mlu(10U/μL)

2.0μL

质粒DNA

2.0μg

DEPCH2O up to

50μL

(2)β病毒载体线性化体系如下,37℃孵育6 h。

10×M Buffer

5.0μL

Spe1(10U/μL)

2.0μL

质粒DNA

2.0μg

DEPCH2O up to

50μL

8.体外转录体系,37℃孵育4h。

Buffer

2.0μL

γNTPs

3μL

线性化产物

2.0μL

DEPCH2O

1.25μL

Cap

0.75μL

T7Enzyme up to

10μL

9.病毒液混合体系

α

β

γ

DEPCH2O

Buffer

总体积

可接苗

1.0μL

1.0μL

1.0μL

9μL

12μL

24μL

3颗

2.0μL

2.0μL

2.0μL

18μL

24μL

48μL

6颗

3.0μL

3.0μL

3.0μL

27μL

36μL

72μL

9颗

4.0μL

4.0μL

5.0μL

36μL

48μL

96μL

12颗

5.0μL

5.0μL

5.0μL

45μL

60μL

120μL

15颗

10.接种病毒操作步骤

在小麦第二叶完全抽出,两叶齐长时选择生长良好的小麦植株,戴上无粉乳胶手套,用移液枪吸取8μL混合液到食指上,使拇指和食指轻轻接触,蘸取混合液,利用摩擦接种法涂抹(注意用力适当)小麦第二叶基部来回摩擦,直至手指上混合液用尽。每个载体独立接种,不同的接种植株用不同的工具进行标记。标签写上小麦材料、接种人姓名与接种日期。

可行性分析:

本课题组从事小麦抗白粉病机制研究已有多年,满足上述所需的实验材料与相关方法仪器设备。所需材料92R137供应足够,本人也已掌握上述技术,熟悉实验流程。

4. 研究创新点

本课题利用抗白粉病Pm21位点编码CC-NBS-LRR的NLR1-V基因,以CC结构域为诱饵,更简易高效的筛选出互作基因。采用VIGS技术,研究周期短,不需要遗传转化,可在不同的遗传背景下生效,相对于传统的基因功能分析方法更简单、快速、有效以及实现高通量。

5. 研究计划与进展

2018年7月-2018年8月

学习和掌握实验室基本实验操作,阅读相关文献资料,锻炼自己的实验技能、完善实验背景知识。

2018年9月-2018年10月

剩余内容已隐藏,您需要先支付 10元 才能查看该篇文章全部内容!立即支付

以上是毕业论文开题报告,课题毕业论文、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。